Výbor Komory je podle čl. 10 statutu výkonným orgánem, který řídí činnost Komory v období mezi dvěma sněmy. Za svou činnost odpovídá sněmu. Má šest sněmem volených členů, jednání výboru se též účastní tajemník.
Výbor rozhoduje o všech záležitostech Komory, které statut nebo usnesení sněmu nesvěří jinému orgánu Komory, zejména:
připravuje podklady pro jednání sněmu a zajišťuje výkon jeho usnesení,
vypracovává návrh rozpočtu a odpovídá za hospodaření Komory,
vypracovává návrhy norem Komory,
rozhoduje o odvolání proti rozhodnutí disciplinární komise,
zřizuje výkonné útvary nebo odborné rady Komory,
předkládá příslušným orgánům stanoviska Komory k legislativním úpravám či jiným materiálům v oblasti účetnictví a souvisejících oborů.
Složení výboru zvoleného sněmem dne 29. června 2010